Jonas Folger corre la sua prima gara del Motomondiale nel 2008, in 125 con KTM e successivamente passa ad Aprilia per tre anni, e nel  2011 arriva la sua prima vittoria. Nella categoria minore corre per altri due anni, ottenendo nel 2013 il suo miglior piazzamento finale, il quinto posto. Dal 2014 al 2016 passa alla Moto2, dove in sella a una Kalex, ottiene il primo successo nel 2015 nella gara inaugurale del Qatar e replicando qualche gara dopo a Jerez de la Frontera. Settimo assoluto nel 2016, con un successo di Brno e cinque podi all'attivo, passa poi nel 2017 in MotoGP, in sella alla Yamaha M1 del team Monster Yamaha Tech 3.